「音樂，不啻是氣氛營造的需要，也可以讓人想起某個年代。」導演王家衛說。
在電影《花樣年華》裡，從傳統戲曲到五十年代的電影歌曲，從上海時期的時代曲到香港菲律賓樂隊的拉丁風情，林林總總，雜亂紛陳，其實都是從上海移民香港的王家衛從收音機聽來的。藉著音樂，導演不但重塑了自己的童年記憶，也是對六十年代的印象。
電影的主題音樂，伴隨著男女主角周慕雲（梁朝偉飾）與蘇麗珍（張曼玉飾）的邂逅反覆出現，乃源自鈴木清順的電影音樂《夢二》，由梅林茂作曲。誘人的華爾滋，弦樂的整體處理教人著迷，象徵著男女舞蹈員互相試探、浪漫迷人的舞步。舞蹈的節奏，也是兩性激情與因循守舊的交纏與衝突的化身。
電影中所有的戲曲片段皆來自名家的歷史性錄音。京劇著名老生譚鑫培（1847-1917）的代表作《四郎探母》及《桑園寄子》，唱腔細膩婉轉，自成一格。粵劇《西廂記》之《紅娘會張生》、越劇《情探》和評彈《妝台報喜》，無獨有偶，皆是描述兩情相悅、私訂終身，又或故弄玄虛、旁敲側擊與及見異思遷的男女情事。
然而，當年最深入人心的，恐怕是三十年代竄紅歌壇、有「金嗓子」美譽的周璇（1918-1957）。她在電影《長相思》（1946）中演唱的一曲《花樣的年華》，道盡了一位綺年花貌的女子，對未來美好生活的嚮往。在《花樣年華》中飾演房東太太的潘迪華，本人也是五、六十年代的大歌星，她那充滿異國風情的《梭羅河畔》（印尼民歌改編），是當時夜總會樂隊伴奏歌曲的典範，正合舞廳跳舞的節拍。《月兒彎彎照九州》及《雙雙燕》亦是同期受歡迎的歌曲。
黑人爵士歌手納京高的作品《那雙綠色的眼睛》、《也許、也許、也許》及《你說你愛我》，卻原來是導演母親的摯愛。
故事的終結是，男女主角分別四年後，周氏獨自來到柬埔寨的吳哥窟，此時米高．加拉索的一段凸顯主人翁悔恨之情、讓人縈繞於心的弦樂，正好與梅林茂的主旋律互相呼應。
